MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-6

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020390	CTT	2	6	1599	1604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202017
2	NC_020390	GTT	2	6	1626	1631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202017
3	NC_020390	TA	3	6	1663	1668	50 %	50 %	0 %	0 %	452202017
4	NC_020390	TCT	2	6	1681	1686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202017
5	NC_020390	TCT	3	9	1715	1723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202017
6	NC_020390	AT	3	6	1811	1816	50 %	50 %	0 %	0 %	452202017
7	NC_020390	TGT	2	6	1877	1882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202017
8	NC_020390	AAT	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202018
9	NC_020390	ATTTTC	2	12	2465	2476	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202018
10	NC_020390	TTCA	2	8	2506	2513	25 %	50 %	0 %	25 %	452202018
11	NC_020390	TG	3	6	2541	2546	0 %	50 %	50 %	0 %	452202018
12	NC_020390	ATT	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202018
13	NC_020390	AATT	2	8	2668	2675	50 %	50 %	0 %	0 %	452202018
14	NC_020390	ACAAT	2	10	2729	2738	60 %	20 %	0 %	20 %	452202018
15	NC_020390	TA	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	452202018
16	NC_020390	TTA	2	6	2789	2794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202018
17	NC_020390	TTTA	2	8	2809	2816	25 %	75 %	0 %	0 %	452202018
18	NC_020390	T	7	7	2871	2877	0 %	100 %	0 %	0 %	452202018
19	NC_020390	ATG	2	6	2956	2961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202018
20	NC_020390	TTTCTA	2	12	2982	2993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202018
21	NC_020390	CAAA	2	8	3511	3518	75 %	0 %	0 %	25 %	452202019
22	NC_020390	A	7	7	3616	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	452202019
23	NC_020390	AGA	3	9	3633	3641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202019
24	NC_020390	CCA	2	6	3681	3686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202019
25	NC_020390	AC	3	6	3746	3751	50 %	0 %	0 %	50 %	452202019
26	NC_020390	TCT	2	6	3762	3767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202019
27	NC_020390	TAT	2	6	3775	3780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202019
28	NC_020390	T	6	6	3784	3789	0 %	100 %	0 %	0 %	452202019
29	NC_020390	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202019
30	NC_020390	CAA	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202019
31	NC_020390	TAA	2	6	4023	4028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
32	NC_020390	CA	3	6	4047	4052	50 %	0 %	0 %	50 %	452202019
33	NC_020390	GAA	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202019
34	NC_020390	AT	3	6	4100	4105	50 %	50 %	0 %	0 %	452202019
35	NC_020390	AAAAAG	2	12	4109	4120	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202019
36	NC_020390	TATG	2	8	4161	4168	25 %	50 %	25 %	0 %	452202019
37	NC_020390	CAAAA	2	10	4169	4178	80 %	0 %	0 %	20 %	452202019
38	NC_020390	AACAAA	2	12	4282	4293	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452202019
39	NC_020390	TAA	2	6	4329	4334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
40	NC_020390	GAA	2	6	4345	4350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202019
41	NC_020390	ATA	2	6	4417	4422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
42	NC_020390	A	7	7	4563	4569	100 %	0 %	0 %	0 %	452202019
43	NC_020390	ATA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
44	NC_020390	A	7	7	4596	4602	100 %	0 %	0 %	0 %	452202019
45	NC_020390	ATT	2	6	4623	4628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202020
46	NC_020390	CTTTA	2	10	4634	4643	20 %	60 %	0 %	20 %	452202020
47	NC_020390	A	6	6	4693	4698	100 %	0 %	0 %	0 %	452202020
48	NC_020390	T	8	8	4803	4810	0 %	100 %	0 %	0 %	452202021
49	NC_020390	TAT	2	6	4825	4830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202021
50	NC_020390	ATA	2	6	4923	4928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202021
51	NC_020390	A	6	6	4933	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	452202021
52	NC_020390	A	6	6	4952	4957	100 %	0 %	0 %	0 %	452202021
53	NC_020390	T	6	6	4981	4986	0 %	100 %	0 %	0 %	452202021
54	NC_020390	AATC	2	8	5002	5009	50 %	25 %	0 %	25 %	452202021
55	NC_020390	TTA	2	6	5098	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
56	NC_020390	CCAA	2	8	5120	5127	50 %	0 %	0 %	50 %	452202022
57	NC_020390	TG	3	6	5157	5162	0 %	50 %	50 %	0 %	452202022
58	NC_020390	CTG	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202022
59	NC_020390	GCT	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202022
60	NC_020390	TAA	2	6	5253	5258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
61	NC_020390	ATT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
62	NC_020390	TTG	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202022
63	NC_020390	CCA	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202022
64	NC_020390	ATT	2	6	5418	5423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
65	NC_020390	TAT	2	6	5459	5464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
66	NC_020390	TCTAAT	2	12	5575	5586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202022
67	NC_020390	AT	3	6	5608	5613	50 %	50 %	0 %	0 %	452202022
68	NC_020390	AAT	2	6	5637	5642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
69	NC_020390	T	7	7	5700	5706	0 %	100 %	0 %	0 %	452202022
70	NC_020390	TCT	2	6	5749	5754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202022
71	NC_020390	AAC	2	6	5763	5768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202022
72	NC_020390	ATA	2	6	5786	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
73	NC_020390	T	6	6	5820	5825	0 %	100 %	0 %	0 %	452202022
74	NC_020390	ATA	2	6	5833	5838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
75	NC_020390	AAT	2	6	5864	5869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.